荧光免疫组化技术主要靠观察标本的荧光抗体染色结果作为抗原的鉴定和定位，因此标本的制作十分重要。在制作标本过程中应力求保持抗原的完整性，并在染色、洗涤和包埋过程中不发生溶解和变性，也不扩散至邻近细胞或组织间隙中。标本要求尽量薄些，以利抗原抗体接触和镜检。标本中干扰抗原抗体反应的物质要充分洗去，有传染性的标本要注意安全。

　　1．标本的类型 基质标本是指固定在玻片上用作抗原的组织、细胞和微生物等。用于荧光免疫组化技术的基质标本有以下几种：

　　（1）涂片和印片 血液、细菌培养物、脑脊液、体腔渗出液和细胞悬液等均可简单地涂抹在玻片上，干燥固定后就可用于荧光抗体染色。脑脊液、脏器（肝、脾、淋巴结等）、细菌菌落或尸体病变组织可把切面压印于玻片上作成印片，经固定后再染色。

　　（2）组织切片 这是组织学和细胞学最常用的显微镜标本片。主要有以下两种：①冷冻切片：为了使抗原最大量的保存，首选的制片方法是冷冻切片，其优点是操作简单，组织的抗原性保存好，自发荧光较少，特异荧光强，同时适用于不稳定的抗原，缺点是组织结构欠清晰。②石蜡切片：石蜡切片是研究形态学的主要制片方法，它不但是观察组织结构的理想方法，而且可进行回顾性研究。其优点是组织细胞的精细结构显现清楚，但对抗原的保存量不如冷冻切片，并有组织自发荧光和非特异性荧光，需加酶消化处理。

　　（3）细胞培养标本 用HEP-2细胞或Hela细胞培养，待细胞在玻片上形成单层，固定后用作抗核抗体等检测的抗原片。还可使细胞单层生长在玻片上，再用病毒或病人标本感染，然后固定，用荧光抗体染色法检测病毒。

　　（4）活细胞染色 检查淋巴细胞表面抗原以及免疫球蛋白受体、癌细胞表面抗原、血清中抗癌细胞抗体等，均可用活细胞荧光抗体染色法。当同时观察细胞表面两种抗原的分布和相互关系时，可用双标记法进行染色。

　　2．标本的固定 标本固定的作用不仅使细胞内蛋白质凝固，终止细胞内酶反应过程，防止细胞自溶，以保持细胞固有形态和结构，更重要的作用是保存组织细胞的抗原性，防止标本从玻片上脱落，除去妨碍抗体结合的类脂，易于保存。固定标本的原则应不损伤细胞的形态、细胞内的抗原和细胞膜的通透性。

　　蛋白质类抗原如血清蛋白质和抗体，可用乙醇或甲醇固定；微生物抗原可用丙酮或三氯化碳固定；如需除去病毒的蛋白质外壳，则可使用胰蛋白酶；多糖类抗原用10% 福而马林固定或以微火加热固定。如有粘液物质存在，应用透明质酸酶等处理除去。类脂质丰富的组织进行蛋白、多糖抗原检测时，需用有机溶剂（乙醚、丙酮等）处理除去类脂。

　　3．标本的保存 标本在固定干燥后，最好立即进行荧光抗体染色及镜检。如必须保存时，则应保持干燥，置4℃以下保存。一般细菌涂片或器官组织切片经固定后可保存一个月以上。但病毒和某些组织抗原标本抗原性丧失很快，数天后就失去其抗原性，需在-20℃以下保存。