应用BAS系统进行分离提纯mRNA的Poly
AT tractRmRNA 是promaga公司90年代的专利注册商品,该法是免疫生物学与材料学结合,制备免疫磁珠,作为标记亲合素的载体颗粒。其原理是基于寡聚胸腺嘧啶脱氧核糖核苷[01igo(dT)]与mRNA3’端polyA的碱基互补配对特性,用生物素标记o1igo(dT),通过它与mRNA3’端的polyA高效杂交形成复合体,然后用标有亲合素的顺磁球珠和磁性分离架捕获,并洗涤生物素o1igo
(dT)/mRNA-亲合素磁珠,最后用无RNase去离子水将mRNA洗脱下来,达到从总RNA分离mRNA 的目的。
Poly AT tractRmRNA分离系统组成包括①生物素标记o1igo(dT)探针(50pmol/μ1);②20XSSC;⑧亲合素磁性球珠TM;④无水RNase水;⑤供12X75mm试管用磁性分离
架。
少量mRNA分离程序如下:
1.在无RNase的1.5m1Eppendorf管中加入0.1—1mg的总RNA及无RNase水至终体积为50μ1。65℃加热10min。
2.加3μ1生物素标记oligo(dT)和13μ1的20XSSC于上述RNA管中,轻轻混合,使自然冷却至室温(约10min),此步是oligo(dT)与mRNApotyA退火处理。
3.亲合素顺磁球珠(SA—PMPS)冲洗处理:
1) 将磁珠(SA—PMPS)轻晃使之散开,置磁性分离架,使SA—PMPS在磁性作用下集中于试管一侧,约30s。
2) 小心去除上清(勿离心!!),再以0.3m10.5X SSC漂洗SA—PMPS。在磁性分离架集中磁珠后,再除上清,依此重复漂洗3次。
4.漂洗后的SA—PMPS重悬于0.1m1的0.5XSSC(30min内使用,因SA—PMPS在无蛋白环境不稳定)。
5.将步骤2中的全部01i80(dT)/mRNA退火反应物加至放有漂洗好的SA—PMPS
1.5m1的Eppendorf管轻轻混匀,放置室温10min。 ;
6.磁性捕获SA—PMPS—oligo(dT)—生物素,小心吸取上清(在确定mRNA分离效果前,最好暂不丢弃上清)以0.1XSSC
0.3m1洗磁珠3次,洗时轻晃管底使颗粒全部悬浮,最后一次尽量移去水相。
7.洗脱mRNA以0.1m1无RNase水重悬磁珠,并以分离架捕获集中SA—PMPS,洗脱液存入新eppendorf管(此为收集的含洗脱mRNA的溶液)。重复洗脱合并,总量为
0.25m1。
8.mRNA的沉淀与贮存
1)mRNA若用于cDNA克隆,可加0.1体积的3mo1/L KAc或NH4AC和1.0体积的异丙醇加入洗脱液,过夜沉淀。
2)12000g离心10min,收集RNA沉淀,用1ml冰冷的75%乙醇洗涤并离心,真空干燥。短期贮存,可将真空干燥的mRNA沉淀溶于无RNase去离子水,浓度为0.5—1.0mol/μl,-70℃存放。
Poly AT tractRmRNA分离系统的各成分应于4℃存放,6个月内活性稳定。
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